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R, un projet de calcul statistique

The R Project for Statistical Computing http://www.r-project.org/

R est un logiciel libre permettant de faire des calculs statistiques (test de Student, Anova, ACP, Chi2, etc.), et de visualiser les résultats sous forme de graphiques, voir de rapports d'analyses complets. C'est aussi un langage de script, permettant d'écrire des programmes d'analyses statistiques complexes. C'est un logiciel en ligne de commande, mais de nombreux projets d'applications graphiques dédiés sont développés autour de R.

Installation

Depuis les dépôts officiels

À ce jour (novembre 2007), c'est la version 2.6.0. L'installation de R est très simple : il suffit d'installer le paquet r-base. R dispose de nombreuses fonctions supplémentaires disponibles sous la forme de paquets téléchargeables (un peu comme ubuntu). Pour pouvoir installer certains de ces paquets, il vous faut de quoi les compiler. C'est pourquoi il est aussi conseillé d'installer le paquet r-base-dev.

Ubuntu 6.06 LTS

Sous Dapper, une manipulation en plus :

Éditer le fichier des polices X11 /etc/X11/xorg.conf et rajouter dans la section « "Files" » à la suite des « FontPath » :

FontPath        "/usr/share/fonts/X11/misc"
FontPath        "/usr/share/fonts/X11/100dpi/:unscaled"
FontPath        "/usr/share/fonts/X11/75dpi/:unscaled"
FontPath        "/usr/share/fonts/X11/Type1"
FontPath        "/usr/share/fonts/X11/100dpi"
FontPath        "/usr/share/fonts/X11/75dpi"

Sauvegarder puis redémarrez.

Depuis les dépôts CRAN

(disponible depuis la Dapper ) (Il n'y a pas de version 64 bits sous Dapper...)

Pour avoir la dernière version de R,

Ajoutez le dépôt suivant à vos sources de mise à jour (et rechargez la liste des paquets) :

deb my.favorite.cran.mirror/bin/linux/ubuntu ubuntu_name/

my.favorite.cran.mirror est l'adresse du miroir disponible sur le site de CRAN et ubuntu_name est le nom de votre distribution Ubuntu.

Exemple : pour une Feisty depuis le miroir de Lyon :

#CRAN-mirror for R
deb http://cran.univ-lyon1.fr/bin/linux/ubuntu feisty/

Ensuite, installez le paquet r-base et répondez positivement à toutes les questions si vous désirez la dernière version.

Afin de faciliter les mises à jour via l'interface graphique, il est possible d'enregistrer la clé d'authentification. Pour cela, taper dans un terminal :

gpg --keyserver subkeys.pgp.net --recv-key E2A11821
gpg -a --export E2A11821 | sudo apt-key add -

Installer une interface graphique

RKward est une interface graphique de R pour KDE. Installez le paquet rkward pour en bénéficier.

Rcmdr est une interface graphique indépendante du système d'exploitation. Installez le paquet r-cran-rcmdr pour en bénéficier. Puis lancer R en mode administrateur:

sudo R
library(Rcmdr)

Vous pourrez ensuite faire les mises à jours nécessaires des bibliothèques.

Lancement

  • En ligne de commande: R
  • Avec l'interface KDE: Lancez RKward.
  • Avec l'interface graphique R commander (Rcmdr): il faut ouvrir un terminal, lancer R puis charger Rcmdr :
R
library(Rcmdr)

Manuels

En français

  • Un manuel assez complet est disponible ici.
  • Une introduction au système R est disponible ici.
  • Un manuel de programmation en S est disponible ici.

En anglais ou autre

Vous trouverez la documentation officielle ici.

Sources


r.txt · Dernière modification: Le 13/08/2008, à 17:45 par zonder
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